Вообще-то это цитата из агитпроповской книжки которую от имени Гагарина настрочили. А реальный Гагарин выступал за восстановление Храма Христа Спасителя. Да и Православная церковь никакого возражения и возмущения полетами в космос не высказывала, напротив, на Байконуре сегодня храм, и с удовольствием туда космонавты приходят.
Это сейчас есть храм на Байконуре. А вообще - при Хрущёве гонения на РПЦ были очень сильны. Поэтому и Гагарин и космонавтика в целом, использовались для агитации по полной программе.
Говорят, что на войне атеистов нет. Думаю, что среди космонавтов тоже. Но тогда эти чувства все тщательно скрывали.